Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17333C6EQI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17333C6EQI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17333C6EQI3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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