Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn7aB1AYL1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms