Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Trabd2bB1ATG9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Trabd2bB1ATG9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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