Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm11127A7VMS2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11127A7VMS2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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