Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp8b5A3FIN4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp8b5A3FIN4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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