Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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