Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ambra1A2AH22 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ambra1A2AH22 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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