Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pramef6A2A8M8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms