Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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