Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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