Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms