Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nek3Q9R0A5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms