Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc1Q9QZF2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc1Q9QZF2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc1Q9QZF2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc1Q9QZF2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc1Q9QZF2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc1Q9QZF2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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