Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms