Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms