Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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