Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl28Q9JIL2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl28Q9JIL2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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