Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
OtofQ9ESF1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms