Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3bQ9ES34 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3bQ9ES34 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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