Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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