Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clstn1Q9EPL2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms