Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmco5aQ9D9D5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms