Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Snx5Q9D8U8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Snx5Q9D8U8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Snx5Q9D8U8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Snx5Q9D8U8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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