Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Derl3Q9D8K3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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