Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc7Q9D541 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc7Q9D541 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc7Q9D541 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc7Q9D541 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc7Q9D541 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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