Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx29Q9D3S3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx29Q9D3S3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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