Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd2Q9D1L0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms