Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms