Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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