Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Fcf1Q9CTH6 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcf1Q9CTH6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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