Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nudt21Q9CQF3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms