Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Chmp3Q9CQ10 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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