Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms