Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms