Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms