Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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