Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RfxapQ8VCG9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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