Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Top1mtQ8R4U6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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