Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab11fip5Q8R361 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms