Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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