Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Prpf39Q8K2Z2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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