Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcho1Q8K285 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms