Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek9Q8K1R7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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