Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rasgef1bQ8JZL7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rasgef1bQ8JZL7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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