Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms