Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms