Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ercc8Q8CFD5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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