Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup88Q8CEC0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup88Q8CEC0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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