Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Usp20Q8C6M1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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