Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek11Q8C0Q4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek11Q8C0Q4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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